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La Polymerase Chain Reaction (PCR)
ou en français "amplification en boucle à l’aide de la polymérase" est une technique issue de la recherche en génétique et qui a rapidement trouvé des applications cliniques en médecine: détection de virus, de certaines bactéries, recherche de paternité, dépistage de maladies génétiques (prénatal ou chez l'adulte).
Dans le cas précis de nos bassins, la PCR est utilisée actuellement pour poser le diagnostic de certitude d'infection par le KHV (koi herpès virus).
Le but de la technique est de réaliser un grand nombre de copies (amplifier) d’un segment déterminé d’ADN du virus qu'on veut détecter, et ce pour rendre le virus "visible". Cette amplification produit une bande sur un gel (voir plus loin) qui est spécifique par sa taille du virus qu'on chercher à mettre en évidence. Lorsque cette technique est bien mise au point, elle est à la fois très sensible (amplification possible au départ de quelques cellules infectées par le virus seulement) et très spécifique.
Petit rappel concernant l'ADN:
L’ADN (acide désoxyribonucléique, support de l’information génétique) est une sorte de long mot écrit avec un alphabet de 4 lettres ou bases. Chaque base est constituée par un sucre (désoxyribose) qui porte un nucléotide au choix : adénosine (A), thymine (T), guanine (G) ou cytosine (C).
Les sucres font l’ossature de la chaine d’ADN, liés les uns aux autres par leur phosphate qui se lie au carbone du désoxyribose suivant. L’ADN est « double brin » ce qui veut dire que deux chaines de désoxyribose se font face comme les montants latéraux d’une échelle. Les nucléotides se retrouvent au milieu et forment des liaisons hydrogène avec les nucléotides qui leur font face (barreaux de l'échelle). La thymine forme deux liaisons avec l’adénosine, la guanine forme trois ponts hydrogène avec la cytosine. Les ponts hydrogène peuvent être rompus par la chaleur. Un sens de lecture de l’ADN a été choisi. On définit ainsi un brin dit 5’- 3’ et le brin 3’- 5’ qui se lit dans l’autre sens. Le brin 3’-5’ est une "copie complémentaire" de l’autre brin ou C est remplacé par G, G par C, A par T et T par A.
L’ADN replié sur lui-même en hélice constitue chez l’homme et les animaux les chromosomes. Il est en revenche circulaire chez les bactéries.
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